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Tris緩沖液是蛋白質(zhì)電泳和蛋白質(zhì)印跡的組成部分。大多數(shù)SDS-PAGE凝膠、電泳緩沖液和印跡緩沖液都用Tris緩沖。
Tris緩沖液在蛋白質(zhì)電泳中的應(yīng)用
大多數(shù)SDS凝膠使用不連續(xù)的Tris緩沖系統(tǒng)。濃縮凝膠具有大孔,因此較大的肽可以輕松遷移通過,通常在pH6.7–6.8下配制。在此pH值下,離子化的氯離子會迅速遷移,從而提高它們后面的pH值并產(chǎn)生一個(gè)具有低電導(dǎo)率區(qū)域的電壓梯度,這會導(dǎo)致甘氨酸(來自運(yùn)行緩沖液)電離并遷移到氯離子前沿后面。樣品中的大多數(shù)肽由于結(jié)合了SDS而帶負(fù)電荷,在氯化物和甘氨酸之間遷移,形成窄帶,從而“堆積”。一旦堆棧到達(dá)分離凝膠,其處于較高的pH值(通常為pH值8.7-8.8),甘氨酸的電離增加會使其加速并超過肽段。此外,較小孔徑的分離膠開始產(chǎn)生篩分效果,導(dǎo)致肽段按大小分離。
大多數(shù)蛋白質(zhì)印跡實(shí)驗(yàn)方案使用低離子強(qiáng)度的Tris緩沖液進(jìn)行蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移。轉(zhuǎn)移時(shí)間取決于印跡裝置的類型和感興趣的肽大小范圍。
Tris緩沖液在核酸瓊脂糖電泳中的應(yīng)用
Tris緩沖液廣泛用于DNA瓊脂糖電泳。兩種主要緩沖液是TBE(Tris硼酸鹽/EDTA)和TAE(Tris醋酸鹽/EDTA)。盡管不同形式的DNA的分辨率及其在電泳過程中的遷移率存在一些差異,但這些Tris緩沖液通常可以互換使用。TBE中的硼酸鹽離子會抑制許多酶,因此如果在電泳后不進(jìn)行某種類型的DNA純化,一些酶介導(dǎo)的下游操作可能不起作用。
制作Tris緩沖液
Tris緩沖液是大多數(shù)生物系統(tǒng)的不錯(cuò)選擇,因?yàn)樗?/span>25°C時(shí)的pKa值約為8.1,使其成為pH7-9范圍內(nèi)的有效緩沖液。該pH值范圍適用于大多數(shù)生物過程。Tris粉末也比更專業(yè)的緩沖液(如HEPES)更便宜且更耐用。
有兩種方法可以制備Tris緩沖溶液。一種是制備所需濃度的Tris堿和Tris-HCl溶液,然后將一種溶液(通常為Tris-HCl)的等分試樣添加到另一種(通常為Tris堿)溶液中,同時(shí)監(jiān)測pH值直至獲得正確的pH值。在實(shí)踐中,很少這樣做。
制作大多數(shù)常用Tris緩沖液的常用方法是僅從Tris堿基開始。將適量的Tris粉末溶于水中,用HCl調(diào)節(jié)pH值,然后將緩沖液配制成所需體積。假設(shè)在調(diào)節(jié)pH值時(shí)沒有過沖,該方法不會改變離子強(qiáng)度。但是,在過沖并用NaOH重新調(diào)整后,或使用Tris-HCl并用NaOH調(diào)整pH值后,離子強(qiáng)度會發(fā)生變化。根據(jù)Tris緩沖區(qū)的預(yù)期用途,此類更改可能重要也可能不重要。